2、消化不同植物蛋白中缺乏免疫球蛋白，穀類中則相對缺乏賴氨酸等。植物蛋白的消化、吸收要比動物蛋白差。動物蛋白相對與人類的營養結構比較吻合，其蛋白質的種類和結構更加接近人體的蛋白結構和數量，而且一般都含有人體必需的8種氨基酸(特別是蛋製品和奶製品)，所以動物蛋白質比植物蛋白質營養價值高。

3、來源不同豬肉、牛肉、羊肉以及家禽、魚類等的蛋白質都有接近人體所需要的各種氨基酸的含量。貝類蛋白質也可與肉、禽、魚類相媲美。它們都是膳食蛋白質的良好來源，其蛋白質含量一般10-20%。植物蛋白是主要來源於米麵類、豆類，但是米麵類和豆類的蛋白質營養價值不同。米麵類來源的蛋白質中缺少賴氨酸（一種必需氨基酸），因此其氨基酸評分較低，僅為0.3～0.5，這類蛋白質被人體吸收和利用的程度也會差些。

植物蛋白和動物蛋白本質上沒有太大的區別，而在氨基酸組成和數量上有一定的不同。植物蛋白中缺乏免疫球蛋白，穀類中則相對缺乏賴氨酸等成分。且植物蛋白的吸收要比動物蛋白的吸收相對來說要困難一些。植物蛋白質因外周有纖維包膜包裹，而難以被消化。而動物蛋白相對於與人類的營養結構比較合適，其蛋白質的種類和結構，更加接近人體的蛋白質結構和數量。