1.複雜性
要保證生鮮農產品在冷鏈物流過程中的品質，就必須嚴格控制農產品在冷藏運輸過程中的儲藏溫度以及整個的運輸時間。冷鏈物流系統相對於常溫物流系統技術要求高，不同的農產品對溫度控制的要求和可儲存的時間都不一樣，還有冷鏈物流的基礎設施建設和裝置技術相對複雜，以及對整個供應鏈資訊系統和資訊化程度的要求較高也突出了農產品冷鏈物流的複雜性。
2.時效性
由於生鮮農產品易腐爛在常溫環境下不易儲藏的特性，要求生鮮農產品冷鏈物流的每個組成單位必須及時有效地工作。流透過程中必須按照相應的時間節點來運輸，整個冷鏈的每一個環節都必須協調運作，每一環節都要緊密相連，來縮短整體的流通時間，提高運作效率。
3.高成本
農產品冷鏈物流的發展需要投入大量資金建設冷鏈物流的基礎設施，前期投資巨大。由於生鮮農產品在流透過程中必須處在相應的溫度環境下，所以必須使用低溫運輸工具，安裝全程溫度控制裝置，建設冷鏈倉儲物流中心，採用先進的資訊管理系統和高效的管理方式，造成了農產品冷鏈物流的成本要比其他物流系統成本高出很多。例如，從廣州到北京運輸荔枝，普通車運輸成本700-800元/噸，而冷藏車運輸成本為1200-1400元/噸。
1.複雜性
要保證生鮮農產品在冷鏈物流過程中的品質，就必須嚴格控制農產品在冷藏運輸過程中的儲藏溫度以及整個的運輸時間。冷鏈物流系統相對於常溫物流系統技術要求高，不同的農產品對溫度控制的要求和可儲存的時間都不一樣，還有冷鏈物流的基礎設施建設和裝置技術相對複雜，以及對整個供應鏈資訊系統和資訊化程度的要求較高也突出了農產品冷鏈物流的複雜性。
2.時效性
由於生鮮農產品易腐爛在常溫環境下不易儲藏的特性，要求生鮮農產品冷鏈物流的每個組成單位必須及時有效地工作。流透過程中必須按照相應的時間節點來運輸，整個冷鏈的每一個環節都必須協調運作，每一環節都要緊密相連，來縮短整體的流通時間，提高運作效率。
3.高成本
農產品冷鏈物流的發展需要投入大量資金建設冷鏈物流的基礎設施，前期投資巨大。由於生鮮農產品在流透過程中必須處在相應的溫度環境下，所以必須使用低溫運輸工具，安裝全程溫度控制裝置，建設冷鏈倉儲物流中心，採用先進的資訊管理系統和高效的管理方式，造成了農產品冷鏈物流的成本要比其他物流系統成本高出很多。例如，從廣州到北京運輸荔枝，普通車運輸成本700-800元/噸，而冷藏車運輸成本為1200-1400元/噸。