首先要確認燕窩是否為黴味，燕窩的正常味道是腥味(來自海洋食物)，木屑味(來自築巢的木屋)，潮溼味(來自燕屋的潮溼氣)。剛燉好後都有一種很清香的味道，而品質更好的燕盞在剛燉好後還有很清香的蛋清味道。如果確認為黴味，就必須小心食用了。 黴菌及黴菌毒素汙染食品後，引起的危害主要有二個方面：黴菌引起的食品變質和黴菌產生的毒素引起中毒。黴菌汙染食品可使食品的食用價值降低，甚至完全不能食用，造成巨大的經濟損失。目前已知的黴菌素約有200餘種，不同的黴菌其產毒能力不同，毒素的毒性作用也不同，按其化學性質可分為肝臟毒、腎臟毒、神經毒、細胞毒及類似性激素樣作用。 所以，黴變部份的燕窩只能切割下來扔掉，剩餘部份仍能正常食用。還沒有黴變的剩餘部份如覺得還有溼氣，可放在空調下吹一晚，溼氣就會消失。市場有很多含水率很高的燕窩，這種燕窩價格極其便宜，但魚龍混雜。真燕窩的含水率最高也可達40-60%，即使放入木盒或防潮箱內儲存仍會變質，如同《賣柑者言》中所謂“金玉其外、敗絮其中”。優質燕窩即使不放在木盒內儲存也是不會產生黴變的，到名店大店購買優質國際品牌的燕窩是杜絕燕窩出現黴變的最佳捷徑。