從機率上分析，出現某種基因排序的可能性微乎其微，每一個鹼基位置有4種可能，如果一個基因只有短短的5個位置，那麼所有的可能性也有4*4*4*4*4=1024種，如果有成千上萬甚至億級的鹼基，那所有組合的可能性多到無法想象。所以想出現指定的組合是很難的。

這一問題涉及生命起源。J.B.S霍爾丹1929年發表生命起源於原始生命湯的理論。所謂的生命湯就是在海洋中的甲烷，氨和水在太陽，火山，閃電等作用下，區域性海域形成大量有機分子，這就是原始湯。接下來，進一步就產生了生命的高階物質RNA，DNA等，DNA就含有鹼基的排列。這也是自然界鹼基的原始排列。但後來這一理論被進化生物學家威廉.馬丁否定。理由是，這一過程不能產生生命所需的能量。但本人認為，這一過程DNA吸取有機物，進行化學反應能夠產生能量，供生命繼續而形成細胞，細胞也同樣具此功能，後來發展成生命體。生命體使這一功能更增強了。

隨著地球生態環境的變化，原始生命湯已不復存在，DNA及所具有的鹼基都來自生命的繁殖，及細胞的分裂而形成新的細胞。給人的印象鹼基排列不是來自自然界。

由於原始生命湯的不存在了，使最初生命起源過程消失的無影無蹤，直到今天生命起源仍不能被破解而成迷。