支原體和衣原體是兩種病原體，支原體比較小，衣原體相對來說是比較大的，他主要是引起人體的泌尿生殖系統感染，衣原體還可以一起沙眼、肺炎、鸚鵡熱這樣一些疾病。這兩種病原體可以同時存在於人體，所以衣原體、支原體都可以感染人體的泌尿生殖系統，引起泌尿生殖系統的感染，這樣的病我們在醫學上統稱為非淋菌性的尿道炎或者宮頸炎，這就是兩個菌可以同時存在，也可以單獨存在。所以我們在臨床上，目前的教課書還是把衣原體、支原體歸為一類來講的。

　　衣原體是一種既不同於細菌也不同於病毒的一種微生物，屬於原核生物，即細胞內沒有形成核膜的細胞核。衣原體與細菌的主要區別是其缺乏合成生物能量來源的ATP酶，也就是說衣原體自己不能合成生物能量物質ATP，其能量完全依賴被感染的宿主細胞提供。而衣原體與病毒的主要區別在於其具有DNA、RNA兩種核酸、核糖體和一個近似細胞壁的膜，並以二分裂方式進行增殖，能被抗生素抑制。

支原體（mycoplasma）：又稱黴形體，為目前發現的最小的最簡單的細胞，也是唯一一種沒有細胞壁的原核細胞。支原體細胞中唯一可見的細胞器是核糖體。