公共資源交易中心和行政服務中心不屬同一系統，級別一般都在正處或副處級財政全額撥款事業單位，因為不是一個系統，所以沒有上下級之說，關係話可能就是相輔相成的關係。公共資源交易中心是負責公共資源交易和提供諮詢、服務的機構，是公共資源統一進場交易的服務平臺。屬於事業單位。公共資源交易中心的內容包括工程建設招投標、土地和礦業權交易、企業國有產權交易、政府採購、公立醫院藥品和醫療用品採購、司法機關罰沒物品拍賣、國有的文藝品拍賣等所有公共資源交易專案全部納入中心集中交易。行政服務中心原名行政審批服務中心，又叫政務服務中心，是集資訊與諮詢、審批與收費、管理與協調、投訴與監督於一體的綜合性行政服務機構。在中國，綜合行政服務機構大都產生於本世紀初，尤其是《行政許可法》頒佈前後。據有關統計資料，全國已有不同層級的綜合行政服務機構3300多家，幾乎覆蓋了全國所有縣市。中國綜合行政服務機構的產生，順應了建設服務型政府的現實要求，是政府公共服務方式和服務程式的一種新的探索。其產生的原因大體可分為事實原因和法律原因。