保守性一般是在進化理論中應用較多，“保守性好”指的是發生突變的機率低隨著遺傳學和分子生物學的進步，進化方面的研究已經遠遠超過物種外在表型的水平了。科學家研究遺傳物質，一般是DNA的序列發現，分類學上親緣關係較近的物種的基因資訊之間的差異也較小，而親緣關係較遠的物種間基因資訊之間的差異也較大。同時由於DNA經過轉錄和翻譯表達蛋白，故蛋白質中的氨基酸序列與DNA含的遺傳資訊也存在很多相關性。故對不同物種間同種蛋白的氨基酸序列分析也是用於研究進化問題的有力方法。以蛋白為例，一般用於進化或物種親緣關係分析的蛋白都含有可變部分--非保守區，和穩定部分--保守區。對於進化上相關的物種，同種蛋白的保守區序列高度相似(前提是都含有此種蛋白);而非保守區序列因物種間差異的增大而逐漸明顯，這是變異加自然選擇在分子水平的結果。並且科學家透過計算非保守區序列的變換特點發現，自然變異機率基本固定，故還能從含同一蛋白的不同物種間計算它們在進化中大致的相差年代。故更準確地說，要分析不同物種間差異性，更多要分析其生物大分子的非保守區序列差異