有GCMS最好，這樣可以直接在譜庫裡搜到化合物的結構式，前提是庫裡有這個物質。再就是GC直接打標樣看出峰時間，同一化合物在不同極性的色譜柱上出峰時間是不同的，舉個例子非極性柱也就是沸點柱 苯的沸點80.1℃ 環己烷沸點80.7℃ 這兩個化合物在色譜柱(非極性柱)不進行降溫操作的情況下是分不開的，如果在極性柱上苯和環己烷的保留時間是不同的，所以凡事無絕對!

首先保留時間與標準峰要完全一致，你可以透過加標的方式來確認，加標濃度大致與目標響應相當，若加的標準峰與目標物完全重疊，則可認為是單個組分，若出現肩峰，則表明有雜峰。如果是DAD檢測器，可以透過光譜圖來識別，一般的HPLC-DAD就自帶峰純度檢測功能，綠區越大表明峰越純。當然你自己也可以看，因為峰是短時間內多次掃描的再擬合成的峰形，在每一條的光譜圖代表一次掃描，光譜圖越雜，峰純度越差。

色譜圖上是一個峰不代表這就是一個物質，最根本的方法是透過各種方法鑑定。

可以把色譜分離後的產品收集，然後用核磁共振，紅外，質譜等多種方法鑑定，出去其他的可能，得到確定的結構或組成。

一個很有效的方法是GC-MS。