雞啄肛啄羽毛的原因很多也複雜，主要有一下幾種：

1、飼養密度過大，蛋雞舍空間不足，氣溫高，或氣候潮溼悶熱，雞群煩燥不安，易啄肛啄羽。

2、禽舍光線突然增強，特別春天來臨，氣溫升高，各雞場將雞舍門窗上的塑膠布全部拆除，雞舍內光線突然亮起來，這時如果有脫肛的雞，馬上就會被啄。3、斷喙不好或根本沒有斷喙，雛雞7-9日齡時，就要斷喙，上切去1/2，下切去1/3，開產前補斷（修喙）。

4、育成期飼養不穩定。日糧中蛋白質不足，鈣、磷鹽不夠或比例不合適；含硫氨基酸微量元素、礦物質不夠，粗纖維不足等都可造成啄肛啄羽現象的發生。

5、飼餵發黴飼料，引起肝、腎及胃腸粘膜損傷（腸胃炎）造成營養吸收差，也可造成啄肛、啄羽毛。

6、體外寄生蟲，如羽蝨可引起皮炎、斷羽……造成啄羽甚至脫羽。

7、雞的品種：白羽和褐羽易發生啄肛啄羽；早熟雞，早開產母雞易發生脫肛，加上沒有及時斷喙，易造成啄肛。

8、生殖道疾病：禽流感、新城疫、傳支、大腸桿菌病，衣原體病等常引起生殖道疾病。生殖道發生疾病時，其生理機能降低，嚴重時出現脫肛及啄肛現象。

9、其他原因