乾貨儲存：用保鮮盒或者密封保鮮袋密封好，再將其放置冰箱的保鮮格進行儲存。還有一種儲存方式，是將燕窩放到陰涼通風的地方，徹底風乾，不可直接面對太陽暴曬，以避免營養成份流失，風乾後，再將其放置陰涼無潮的櫥櫃等處，正常溫度以不超過35℃為宜。溼貨儲存（已浸泡完畢的燕窩）：用保鮮膜將其包好並密封或用乾淨的器皿盛裝並密封好，再將其放置冰箱的冷凍格；這樣做的好處在於可防浸泡後的燕窩進水、進油及冰箱內其它食物的串味；為了方便燉制，也可在儲存前先行分包（按每次燉制的量分）。浸泡好的燕窩在冰箱的冷凍儲存時間在30天左右為佳，建議經常食用燕窩的消費者在浸泡時，不可一次浸泡過多，儘量保持吃多少，發多少以及把握食用進度，遵循先泡先吃的原則。濃縮儲存：在未開封之前貯存於冰箱的冷藏格或陰涼乾燥處，開啟之後需在15-20天內食用完畢，在開封的食用過程中，須存於冰箱冷藏。若無法在7-10天食用完，請放至冰箱冷凍，下次吃時，再先行取出解凍。即食燕窩系列：須放置乾燥之處，切忌Sunny直射，常溫下可儲存兩年，開瓶後，須保鮮放在4-6攝氏度的冰箱內，建議4天內食用完畢。