自然界造成動物災害的原因是多方面的。有自然因素，如氣候變化、環境變化使動物的數量、習性發生改變；有動物本身的因素，如繁殖力過強或過弱、數量過多或過少造成生態失衡。乾旱使蝗災暴發，造成農作物顆粒無收；老鼠缺少天敵過度繁殖，猖獗肆虐，不僅吞噬糧食，傳染多種疾病，而且毀壞各種設施；氣候環境變化發生森林病蟲害，使成千上萬畝林木毀滅，其損失遠遠大於森林火災……但更多的原因還在於人類自身。比如對許多動物的亂捕亂殺、森林的亂砍濫伐、草原的開墾、圍湖造田等破壞了動物的食物鏈，毀壞了生物的多樣性；又如過量使用化學農藥，造成水域、空氣和土壤的汙染，生態平衡遭到破壞，並且引起物種變異及抗藥性。比如殺蟲劑DDT的濫用，使之從誕生之初的一支殺蟲利劍很快變成對蚊蟲毫無作用且對人有副作用的廢藥而被淘汰。還有，盲目引進物種，造成外來物種侵入，引發動物易地氾濫。澳洲原本沒有兔子，100多年前，好事之人將24只歐洲穴兔帶到缺乏天敵的澳洲，以致於過度繁殖形成災害。另外，中國在上世紀50年代曾發動一次“除四害”運動，其中將麻雀列為害鳥進行剿滅，這對隨後發生的一些蟲害起到推波助瀾的作用。