1、性質不同

“國藥準字”是藥品生產單位在生產新藥之前，經國家食品藥品監督管理局嚴格審批後，取得的藥品生產批准文號，相當於人的身份證。

"消字號"是經地方衛生部門稽核批准的衛生批號，屬於衛生消毒用品範疇。指標主要為殺菌作用。

2、格式不同

藥品批准文號格式為：

“國藥準（試）字+字母+8位數字”。其中“藥”代表是藥品，這是最基本性質（與保健食品和醫療器械的區別），“準”字代表國家批准生產的藥品，“試”代表國家批准試生產的藥品。

消字號的文號格式為：

“（省、自治區、直轄市簡稱）衛消證字（發證年份）第xxxx號”。

3、 審批條件不同

"準字號"是由國家食品藥品監督管理局審批。並且要經過藥理、病理、毒副作用測試和臨床驗證等一系列環節，在確保安全有效的情況下才可能批准，整個過程通常需要5-10年，費用也高達數百萬甚至數千萬元。

"消字號"產品的許可證發放與管理是由省級以下衛生行政部門負責。審批時間一個月，檢測指標主要為殺菌作用，審批費用僅數千元。