絕密檔案模式，就是解謎+逃跑，在不影響劇情發展的情況下儘量避免和殭屍接觸，一邊解除各種開關（謎題）一邊逃跑，同時在地圖裡不起眼的位置尋找適用的武器在緊急情況下防身和快速逃脫，要注意，任何武器都不是拿來輕鬆擊殺殭屍的，武器就是拿來防身的，第一彈藥不夠用，第二有部分殭屍還穿著防彈衣，第三使用非消音武器的話開槍就會引來殭屍，並且開槍和使用近戰武器（匕首或者撬棍）還會消耗體力，體力越少，槍就越打不準，體力歸零的話，近戰武器無法使用，這也導致你無法迅速清理殭屍。CSOL的絕密檔案模式，解謎的內容很簡單，不外乎就是獲得ID卡開門、推箱子開啟暗道、推箱子讓自己能跳到高地……等等等等，這難度很低，至少沒有半條命系列的解謎那麼複雜，所以絕密檔案模式的重點還是逃跑，地圖中有各種武器，但是一般不建議使用自動武器，比如步槍、衝鋒槍、機槍，這些武器開槍就會消耗大量體力，並且還很難打準——這和玩家扮演的角色的身份有關，玩家扮演的是REX的首席研究員索伊，第一她是個妹子，第二她是研究員，第一，身為妹子，她沒有多少體力能用於戰鬥和射擊，第二，研究員可沒有太多的武器射擊經驗，這也是為何玩家在和殭屍戰鬥的時候如此艱難的原因了。