智子為什麼要讓三體組織暗殺羅輯呢？

1.因為羅輯和葉文傑大神有聯絡，而葉文傑發現了黑暗森林法則。而在當時威懾是唯一的能夠避免地球毀滅的方式。葉文傑對於地球人的感情發生了很大的變化，開始時候因為痛恨惡，因此希望迎接三體星人的到來，拯救地球。隨後因為在生下楊東後，受到了村人照顧而心靈暖化，隨後又因為一些事情徹底變冷。她愛過，也恨過，也給三體星人發過人類與三體星人的第一封信。她不能遺忘恨，也不再想著報復。因此她選擇放手。不管事務。但是她將自己的思想傳給了羅輯，算是在心靈完成了最後的救贖。這是葉文傑傳下黑暗森林法則的原因。但是懵懂無知的羅輯並不知道這是什麼，有多重要。直到被選為面壁計劃的面壁人。

2.羅輯不懂三體星人為什麼要暗殺自己？因此他猜想自己有三體星人恐懼的東西。而經歷了重重磨難後，頓悟了黑暗森林法則。這一點頗有點像是王陽明頓悟“心學”至理一樣。這段頓悟過程很有中國風味。至少大部分做過默默無聞工作，突然一天得到突破應該就是這種感覺吧。

原先為何被暗殺，羅輯根本不知道原因，直到他頓悟了黑暗森林法則。