配製和使用追肥，第一要注意追肥是補充和改善出菇後的培養料營養條件。培養料經過前期大量出菇，內部的營養物質消耗很大，補充一些營養物質，對後期出菇有利。對於補充營養物質問題，一般認為營養液碳氮比值為18～20的稀薄水溶液為好。隨意增加營養物質，不一定對出菇有利，有時作用相反。第二要注意追肥的方法。若施無機礦質元素和維生素類的水溶液，僅噴在覆土層上，增產效果並不明顯。若施有機物的水溶液，稍不慎易遭致病蟲害發生。最好能用注射法或內埋管道進行滴灌，這樣增產效果明顯。目前生產上大多數還是與噴水結合，噴施於覆土層上，讓其慢慢被菌絲吸收利用。

蘑菇追肥應該注意以下問題：

（1）在第3潮菇後可以開始施追肥。一般於每潮菇採收結束後至下潮菇長至黃豆大前進行追肥。

（2）追肥宜在整理好菌床、調好pH、氣溫低於18℃時進行。

（3）追肥濃度不宜太高。噴施追肥後，立即噴清水，以免養料積存於表面而滋生病蟲害。蘑菇健壯劑不能與石灰等鹼性物質混用。

（4）幾種追肥混合或交叉使用，可有提高肥效的作用。