單子葉植物更高等。原始的被子植物都是雙子葉植物，單子葉植物是由雙子葉植物進化來的，所以更高等些。此外單子葉植物中C4植物比例遠高於雙子葉植物，而C4植物在進化上是比C3植物高等的。

關於單子葉植物的起源問題，目前多數學者認為雙子葉植物比單子葉植物更原始、更古老、單子葉植物是從已滅絕的最原始的草本雙子葉植物演變而來，是單元起源的一個分支。

Engler系統把單子葉植物安排在雙子葉植物前，裸子植物具有多子葉，接在雙子葉植物之後，Engler 依子葉的有無和多少安排他的分類系統，最原始的是無子葉植物，單子葉植物比雙子植物原始。在他逝世後，由Mechior將這一安排顛倒過來。

單子葉植物由雙子葉植物發展而來有幾種假設：

1． 水生蓴菜類起源說——主要依據兩者的花粉均為單溝。

2． 陸生毛茛類起源說——由陸生毛茛類——百合類向不同方向演化出各類群的單子葉植物。周俊在證明毛茛類在生物鹼甾體化合物、三萜類脂肪酸、氫苷與百合類相似，較多人贊同單子葉植物起源於雙子葉植物較為原始的型別。