汞是有毒的，但它的化合物和鹽的毒性非常高，口服、吸入或接觸後可以導致腦和肝的損傷。因此，今天的溫度計大多數使用酒精取代汞。一些醫用溫度計仍然使用汞因為它的精確度高。

在標準氣壓和溫度下，純汞最大的危險是它很容易氧化而產生氧化汞，氧化汞容易形成小顆粒從而加大它的表面面積。

雖然純汞比其化合物的毒性低，但它依然是一種很危險的汙染物因為它在生物體內形成有機化合物。

最危險的汞有機化合物是C2H6Hg，僅數微升接觸在面板上就可以致死。

汞是一種可以在生物體內積累的毒物，它很容易被面板以及呼吸和消化道吸收。水俁病是汞中毒的一種。汞破壞中樞神經組織，對口、粘膜和牙齒有不利影響。長時間暴露在高汞環境中可以導致腦損傷和死亡。儘管汞的沸點很高，但在室內溫度下飽和的汞蒸氣已經達到了中毒計量的數倍。

因此在操作汞時要特別小心。盛汞的容器要特別防止它溢位或蒸發，加熱汞一定要在一個通風和過濾良好的罩子下進行。此外，有些汞的化合物會自動還原為純汞，而純汞則會蒸發，這往往會被忽視。