簡單地說,化肥主要彌補了自然界氮磷鉀的不足,但是同時會帶來汙染環境,土壤肥力下降之類的問題.而農家肥雖然效力上比不過化肥,但是是綠色肥料.

一、農家肥可以全面供應作物生長所需的養分.化肥的特點是養分含量高,肥效快而持續時間短,養分較單一；農家有機肥大多是完全肥料,但養分含量低、肥效慢而持續時間長.因此,將化肥與農家肥混合施用可取長補短.

二、農家肥可以減少養分固定,提高肥效.化肥施入土壤後,有些養分會被土壤吸收或固定,從而降低了養分的有效性.若與農家肥混施後,就可以減少化肥與土壤的接觸面,從而減少被土壤固定的機會.

三、農家肥可以積蓄養分,減少養分流失,改善作物對養分的吸收條件.化肥溶解度大,施用後對土壤造成較高的滲透壓,影響作物對養分和水分的吸收,這就增加了養分流失的機會.

四、農家肥可以調節土壤酸鹼性,改良土壤結構.農家肥料可以提高土壤的緩衝能力,調節酸鹼性,使土壤酸性不致增高.

五、農家肥促進微生物活動,增加土壤養分,提高土壤活力.農家肥是微生物生活的原料,化肥供給微生物生長髮育的無機營養.兩者混用就能促進微生物的活動,進而促進有機肥的分解.