流程如下：

、需辦理特殊疾病的參保居民持本人的醫保卡、身份證（未成年人持戶口本）、1寸照片2張和本人的特殊疾病2級及以上醫院相關病史資料到戶籍所在地的社保所申請，領取並填寫申請表，社保所初審並蓋章。

2、參保居民持經社保所初審後的申請表、身份證、醫保卡、本人2級醫院以上（含2級）住院病歷（含檢查原始資料）及相關病史資料到指定診斷醫療機構進行檢查診斷。對診斷合格者，醫療機構收取病史資料，對診斷不合格者，醫療機構退回病史資料。

3、診斷醫療機構辦理流程：參保居民持申請資料到診斷醫療機構醫保辦→醫保辦安排專家按照特病診斷標準進行診斷並出具診斷證明→診斷合格的居民持申請資料和診斷證明交到醫院醫保辦→醫保經辦人員稽核後，將特病資訊維護進系統。

4、特殊疾病診斷合格的居民於次月10號後，帶上身份證、醫保卡、1寸相片2張到戶籍所在地社保所領取《重慶市醫療保險特殊疾病資格證》。

5、特殊疾病待遇享受時間：取得特殊疾病資格證後即可享受。具備特殊疾病資格的人員應按時足額繳納醫療保險費，一個自然年度內未參保繳費的，從其未繳費的次年1月1日起取消特病資格，之後接續繳費的重新按規定申請辦理。