1、性質不同 行政處罰是一種法律制裁，是行政處罰實施機關對違反行政管理秩序的行為，依法律、行政法規、地方性法規、規章和《行政處罰法》規定的程式所給予的制裁。 責令改正或限期改正違法行為則是行政機關在處罰過程中要求違法行為人停止或改正違法行為，是對違法行為人發出的一種作為命令，而不是行政處罰，並未科處新的義務。

2、內容不同 行政處罰是一種懲戒，是對違法行為人的人身自由、財產權利的一種限制或剝奪，從而引起警戒。責令改正或限期改正不是制裁，而是對違法行為的後果及其違法行為本身的糾偏，要麼是停止違法行為，要麼是消除違法行為引發的不良後果，表現為多種形式。

3、行政處罰的形式和責令改正形式有別 行政處罰可分為警告、罰款、暫扣或吊銷許可證或執照、拘留、勞動教養等。責令改正或糾正的形式因各種具體違法行為不同而分為停止違法行為、責令退還、責令賠償、責令改正、限期拆除、限期治理等等。

4、行政處罰和責令改正的直接目的有差別 行政處罰是對公民、法人或其他組織違法行為的懲戒，是違法必究原則的體現，目的是使違法行為人因害怕受罰而不敢違反行政管理秩序；責令改正則是迫使當事人停止違法或履行法律規定的守法義務，以糾正被破壞的社會關係和利益。