省武警總隊直屬武警部隊總部，同時接受省級公安部門的領導。1995年3月，國務院、中央軍委再次對武警部隊領導管理體制作了重大調整，將原來“一統二分”的體制改為“兩統一分”，即由國務院、中央軍委統一領導、統一管理與各級公安機關分級指揮相結合的體制。

這一調整，使中央軍委進一步加強了對武警部隊的領導。1996年12月，根據武警部隊編制人數較多、地理位置特殊、任務較重等特點，中央軍委決定將武警部隊總部由副大軍區級升格為正大軍區級，並於1995年至1999年先後將全國各省、自治區、直轄市總隊升格為副軍級。

除各省武警總隊外，消防總隊，邊防總隊仍是正師級。

武警支隊是在各省武警總隊編成內，各地市設一個團級支隊，以所在地市命名。該武警支隊由省武警總隊和所在地市公安部門雙重領導。而各省總隊還轄有一定規模的武警預備隊，也編成武警支隊，分散在全省範圍內，以序數來命名，只接受省武警總隊領導。

現在部分城市的武警支隊已升格為旅級。

1996年10月，中央軍委先後將解放軍陸軍部隊的14個步兵師轉隸武警部隊序列，直屬武警總部領導管理，作為武警部隊的機動部隊。這就是武警機動師的由來。

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