（1）機身做工有所區別，兩者邊框的金屬切割倒角處理不同，iPhone5s的金屬邊框倒角是光亮的，而iPhoneSE的金屬邊框倒角做了磨砂的效果；
（2）iPhone5se和5s的攝像頭畫素是一樣的，前後攝像頭畫素都是800W畫素。iPhone5se和5s的執行記憶體同樣是1GB，同樣支援指紋識別；
（3）iPhoneSE搭載A9處理器，搭配M9運動協處理器，iPhone5s搭載A7處理器，搭配M7運動協處理器。
（4）iPhoneSE採用4英寸1136x640螢幕，PPI為326，iPhone5s採用4英寸1136x640Retina顯示屏，PPI為326。
（5）iPhoneSE前置120萬＋1200萬像主攝像頭，單畫素尺寸為1.22微米，搭配f/2.2光圈，持4K影片拍攝和LivePhotos。
iPhone5s前置120萬＋800萬畫素後置鏡頭，單畫素尺寸為1.5微米，搭配f/2.2光圈，支援1080p拍攝。
（6）iPhoneSE內建16GB/64GBROM儲存空間，iPhone5s內建1GBRAM＋16GB/32GBROM儲存組合。
（1）機身做工有所區別，兩者邊框的金屬切割倒角處理不同，iPhone5s的金屬邊框倒角是光亮的，而iPhoneSE的金屬邊框倒角做了磨砂的效果；
（2）iPhone5se和5s的攝像頭畫素是一樣的，前後攝像頭畫素都是800W畫素。iPhone5se和5s的執行記憶體同樣是1GB，同樣支援指紋識別；
（3）iPhoneSE搭載A9處理器，搭配M9運動協處理器，iPhone5s搭載A7處理器，搭配M7運動協處理器。
（4）iPhoneSE採用4英寸1136x640螢幕，PPI為326，iPhone5s採用4英寸1136x640Retina顯示屏，PPI為326。
（5）iPhoneSE前置120萬＋1200萬像主攝像頭，單畫素尺寸為1.22微米，搭配f/2.2光圈，持4K影片拍攝和LivePhotos。
iPhone5s前置120萬＋800萬畫素後置鏡頭，單畫素尺寸為1.5微米，搭配f/2.2光圈，支援1080p拍攝。
（6）iPhoneSE內建16GB/64GBROM儲存空間，iPhone5s內建1GBRAM＋16GB/32GBROM儲存組合。