“普通的基因測序”應該是指“常規DNA測序”吧，是用Sanger法（也就是雙脫氧法）進行測序的方法，目前非常普遍的是直接用ABI 3730xl 進行的自動測序，基本上可以做到600bp-800bp的讀長。　　高通量測序的概念其實是一個相對的概念，在2000年的時候，3700、MegaBace等儀器上的測序也是高通量測序，是相對手工測序或者跑平板膠來說的。　　不過到2005年以後，高通量測序就改指第二代測序（Next generation sequencing），454、Solexa(後改為Illumina）和SOLiD等第二代測序，比3730等第一代測序的通量提高了成千上萬倍，甚至上億倍，所以稱為高通量測序。　　NGS的特點主要有：　　1、通量高。一個RUN能產生500Mb-600Gb的資料量。　　2、讀長相對較短。454(約400-500bp)，llumina（100-250bp），SOLiD（75-100）。　　3、單位資料的成本非常低。現在很多專案測序的費用。已經非常低。生物資訊分析成本變得更為重要了。