1、計稅依據不同

計稅依據是查賬徵收與核定徵收最大的區別，查賬徵收是以所得稅額為計稅依據的，可以簡單的為以利潤為計稅依據。核定徵收是以收入*徵定率得出的所得稅額為計稅依據。

2、申報表不同

查賬徵收的申報表是a類報表，核定徵收的申報表是b類報表。

3、填寫內容不同

查賬徵收需要填寫，收入、成本、利潤總額。核定徵收只需要填收入即可。

4、彙算清繳不同

查賬徵收的彙算清繳相當的麻煩，需要計算各種費用的標準，以及提出超額的費用。核定徵收相對比較簡單，只需算準收入即可。

5、財務管理不同

查賬徵收適用與財務管理健全的企業，核定徵收是用於財務管理不健全，成本或者費用無法準確計算的企業。

6、選擇企業不同

選擇企業不同，主要是指企業是一般納稅人，還是小規模納稅人。簡單的來說就是，通常查賬徵收適用於一般納稅人，核定徵收適用於，成本或費用無法準確計算的小規模企業。