操作方法一樣。唯一，不一樣的就是，98版的字根排放位置，進行調整（作者考慮，儘可能少出現重複組合，增加漢字組合的唯一性，而進行調整的）。不過，就目前而言，大部分人都已經習慣86版的字根佈局，所有98版使用都並不多。（因為，習慣了就不太願意再改變，因為，不影響使用的原因）。加上現在大部分，支援五筆的輸入法，使用的核心大部分以86版為主。（這些，輸入法的功能比原版的功能要強大一些。）

我以前也是用86版的，但後來又學了98版。之所以有人說98版的不好用，那是因為他們已經習慣了使用86版的，而兩個版本中的許多字的拆法是不一樣的，一時不好更改。我倒覺得98版的比86版的更好用，因為它不但又添加了許多字根，而且拆字方法也更符合我們寫字的習慣。如果你用金山打字通練習五筆時也會發現它裡面的五筆練習也有兩種版本的區分。等你習慣了用98版後還會發現，98版的簡碼字明顯要多於86版的，同樣的文章，如果用98版來輸入的話明顯要快於86版的（前提當然是你要熟悉98版的）。

“來”字在98版裡被拆成了一、丷、木三部分，所以它的字碼是GU（屬於二級簡碼）。