抑酸藥雖然能起到抑制作用，但是進入體內也會破壞大量的有益菌，當保護胃細胞黏膜的有益菌被破壞掉後，就會出現燒心、胃疼等很多不適症狀

反流性胃炎是由於幽門括約肌功能失調使膽汁反流入胃引起的胃黏膜的慢性炎症，而不是由於胃酸分泌過多引起的胃黏膜的炎症，所以應用奧美拉唑類、雷尼替丁類抑酸劑及碳酸氫鈉等制酸劑是無法起到治療作用的，反而會使膽汁反流的加重，服用制酸劑後出現燒心症狀，是由於膽汁反流入食管，刺激食管黏膜引起的。

膽汁反流性胃炎的治療主要以莫沙必利、曲美布丁等胃動力藥和具有吸附膽汁作用的胃黏膜保護劑硫糖鋁、鋁碳酸鎂顆粒、考來烯胺等聯合治療；反流輕在也可以應用果膠鉍、枸櫞酸鉍鉀、瑞巴派特等胃黏膜保護劑聯合胃動力藥進行治療，病情嚴重而且藥物治療無效者也可以考慮手術治療。儘量避免服用山莨菪鹼、硝苯地平等有抑制幽門括約肌功能的藥物。在平時生活中應該注意飲食及生活習慣調節，避免菸酒、碳酸飲料、濃茶、油膩食物等刺激，少吃多餐，避免飯後劇烈活動。有利於膽汁反流的治療。