區別如下：

1、含有元素不同木薯粉中一般含有氫氰酸，有毒，須經水浸泡後煮熟放能食用；而紅薯粉中不含有氫氰酸，可以食用。

2、來源不同木薯粉：木薯粉是由一種與橡膠同屬的槭科植物的塊莖經過乾製加工成的粉製品，其澱粉含量較高，很多地方稱為木薯澱粉。 紅薯粉：紅薯粉也就是地瓜粉，其來源於我們常見的地瓜，地瓜是薯類植物的一種，這種粉也含有較高的澱粉，屬於粗糧的一種。

3、用途不同木薯粉：在中國木薯粉主要是用來做飼料和食物的新增劑，而在中國臺灣地區常用木薯粉製作芋圓，具有很Q的口感。 紅薯粉：紅薯粉主要是用來製作粉條的，當然也有製作飼料的，其製作的粉條也有一定的彈性，口感比米粉好，香味不如米粉。

4、成分不同木薯粉：木薯粉除了含有大量的澱粉之外，還含有一種毒素——亞麻仁苦苷，這種成分在食用之後會在胃酸的作用下分家產生氫氰酸，這種酸隨人體有毒害作用。 紅薯粉：紅薯粉沒有任何毒素，主要成分是澱粉，在食用之後會使人有一種飽腹感，容易產氣，不適合大量食用。

5、口感不同木薯粉加水遇熱煮熟後會呈透明狀，口感帶有彈性；紅薯粉加工成灰色細長條狀，晶瑩剔透，與粉絲相似。