最終的BOSS戰分為三場戰鬥，第一場就是在海王神殿與夢幻魔神的戰鬥。BOSS在中央的毒池中只會噴出毒液，毒液落到地上會變成怪物來攻擊林克，需要用飛爪把把BOSS身上的紫色毒液全部落下來，然後再將它拉到岸邊，這隻可憐的章魚就任人宰割了。攻擊到一定程度BOSS會飛到空中，從旁邊的樓梯上到二樓再使用弓箭將它把在柱子上的觸手全部射下就能使其返回下層。如此反覆兩個回合後發生事件，林克習得減慢時間的能力，點選螢幕下方的沙漏然後在螢幕中間畫“8”即可發動沙漏能力，BOSS向林克衝來時是最佳發動時機，發動後馬上向它的眼睛猛砍。用過一次沙漏能力後需要等待一定時間才可以發動下一次。第二場戰鬥：與幽靈船結合成一體的BOSS很好對付，在本場戰鬥中需要控制船將BOSS身所有眼睛全部打掉即可，上屏會詳細標出BOSS身上眼睛的情況。BOSS發射的攻擊可以使用大炮將其攔截。第三場戰鬥：戰鬥開始後發動沙漏能力發生劇情，精靈們將會幫助林克壓制魔神的觸手，上螢幕變成BOSS身後的視點，與BOSS拼劍可以慢慢恢復沙漏能力，當上螢幕顯示BOSS眼睛睜開時立刻發動沙漏能力，對準BOSS身後的弱點猛攻，如此反覆經過一段時間的拉鋸戰就能迎來最終的勝利了。