臭氧發生器產生的臭氧是一種很強的氧化劑，它的強氧化性、消毒性和其他一些性質不但廣泛用於汙及工業氧化等方面，而且在水產養殖業上防止水產養殖系統內的疾病及赤潮解毒、改善水質、水消毒等領域也得到了很好的應用。透過臭氧消毒裝置的殺菌裝置可對生物卵消毒、養殖水殺菌、設施消毒，可以防止病原體的侵入。臭氧具有強烈的殺菌消毒和水質淨化作用，而且無毒無害，是水產養殖和育苗生產中最理想的殺菌淨化劑，對防治魚、蝦、臭氧發生器廠海膽、河蟹、甲魚等生物病害，改善水產養殖的生態環境，有著重要的意義。

水產養殖中使用臭氧消毒裝置育苗，成套的臭氧發生器價格並不高，一次性投資也不大，而且可節約各種消毒劑，抗菌素，還可以減少換水量，節約燃料煤，應用臭氧育苗，其成活率至少可提高一倍以上而且一套臭氧發生器可使用數年，從而既可大大節省養殖成本，又可培育出綠色環保食品，從各個方面講是比較經濟的。目前日本及歐美等大部分國家已廣泛採用臭氧進行養殖，並禁止採用氯化物等化學消毒劑進行養殖而造成含氯素過高的產品進入其市場，各大報刊時有報道，所以魚塘裡面的水是完全可以用臭氧消毒的。