建設專案竣工財務決算的內容，包括竣工財務決算報表和竣工財務決算說明兩個部分。建設專案竣工財務決算報表主要有：建設專案概況表；專案竣工財務決算表；專案交付使用資產總表；專案交付使用資產明細表。竣工財務決算說明書主要包括：建設專案概況；會計財務的處理、財產物資清理及債權債務的清償情況；建設專案結餘資金的分配情況；主要技術經濟指標的分析和計算情況；建設專案管理及決算中存在的問題和建議；決算與概算的差異和原因分析；需要說明的其他事項。

根據財政部 國家稅務總局《關於全面推開營業稅改徵增值稅試點的通知》財稅〔2016〕36號

附件2：營業稅改徵增值稅試點有關事項的規定

試點納稅人發生應稅行為，在納入營改增試點之日前已繳納營業稅，營改增試點後因發生退款減除營業額的，應當向原主管地稅機關申請退還已繳納的營業稅。

因此，營改增前已開營業稅票，已繳營業稅，營改增後決算金額低於開票金額，首先應當向原主管地稅機關申請退還多繳納的營業稅。其次，會計上如果已確認收入應衝減收入及相應成本，會計上如果未確認收入應衝減應收賬款及相應工程結算，企業所得稅如果已確認收入應衝減收入及相應成本。