營養師的性質不同。公共營養師主要是隻在公共營養的部分進行學習，主要講的是大眾的健康教育、健康宣傳，而沒有涉及到臨床營養常見多發病的誘因，康復和理療。營養師主要從四個模組(食物選擇、食譜編制、營養評價、營養教育)入手，在公共營養的基礎上結合臨床營養，更為全面，專業，實用性更強。辦證機構不一樣。公共營養師的證書屬於地市級頒證，而且有區域性的限制。營養師的證書是國家部委級頒證，帶國徽和鋼印，全國通用，網上可查，不用年檢、終身陪伴。授課模式不同。公共營養師大部份還在採用固定地點授課的模式來進行營養師的講課。受到時間和空間的限制，對於上班族來說，可能因為趕不上上課時間，而耽誤了其中的一些章節，每次上課還得車旅勞頓，可能還會跑完大半個城區。師資力量不同。公共營養師主要是對公共營養進行學習，請的老師可能比較單一，沒有對臨床營養進行講解，並且有的培訓機構為了節省費用，經常是一個老師從頭講到尾，在學員中產生了很不好的影響。就業、創業幫扶。公共營養師培訓，一般都是取得證書之後，培訓機構和學員的關係就此結束，學員在培訓機構學到的只是書本上的知識，對營養師沒有過多實踐性的教學，也沒有對取得營養師證書後的營養師進行就業創業的輔導。