1、查重時，對word和pdf的文字格式都能夠進行識別，但是pdf出現錯誤的機率會高點，從而PDF格式導致檢測結果為空或者報告亂碼而檢測不準確。因為知網論文查重是按照檢測次數收費的，如果因為格式問題而沒有識別出論文內容就白白浪費錢了。

2、查重時，Word中的圖片和公式基本都是檢測不到的，而在PDF格式中圖片和公式會透過處理識別成文字而進行檢測，這樣識別出來的內容和圖片以及公式有很大差別而被檢測成抄襲，PDF是不合理的。

3、Word文字格式中的參考文獻是標準的文獻格式，知網系統會根據參考文獻來檢測引用率，如果有引用的內容，報告中會有黃色字型，可以看到去除引用後的結果，從而可以看出文章是否過度引用。文章“知網論文查重中，如何標識引用部分才能被知網查重系統識別？”有深入說明。(紅色抄襲，黃色引用)

4、在word文件格式中，目錄是自動生成的，所以知網在檢測時可以根據文件中的章節分類來逐一進行檢測，可以得出更細緻準確的章節檢測結果。更有利於導師審閱和自己針對性的修改。而知網查重PDF版本就沒有這樣的效果。