在進行生物實驗的時候， 我們會使用大量的培養皿來培養我們的細菌，或者說微生物，那麼從土壤中獲得這些微生物，我們要如何進行分辨呢？

首先第一點，我們可以透過肉眼來觀察，那麼每一種細菌，或者說微生物都具有不同的外形，我們所說的外形就是它的顏色特點，還有其他的例如菌斑的形狀等等，這樣可以幫助我們初步判斷微生物。

其次，我們可以透過菌落PCR的方法來進行鑑定。因為這類方法是最快速最便捷的方法，在所有的方法之中。但是缺點也很明顯，因為我們知道如果你想要進行聚合酶鏈式反應，必須要知道引物的序列，也就是我們常說的primer。

你可以透過你要尋找的菌株，在NCBI的網站上，找到那段特異性的區域，設計出你需要的序列完成實驗。

最好如果你完全不知道是什麼？我們可以利用簡單的PCR辨別真菌和細菌，利用16s rRNA序列判別，然後採用高通量測序，得到這個細菌或者這些細菌儘可能多的資訊，透過比對找到它。

其實最確定的分辨微生物的方法，就是測序，我們獲得了微生物的序列之後，進行序列比對，找到我們培養的微生物所在的科屬種，這樣幫助我們進一步判斷微生物的一些特性，其次也可以透過獲得的序列資訊，得到一些微生物可能的潛在功能和作用。