結構化學是物理化學的一個組成部分，是在原子- 分子水平上研究物質分子構型與組成的相互關係、結構和各種運動的相互影響的化學分支學科。因此，結構化學需要的基礎知識大體上有三個方面：

從化學分支學科之間的內在關係上看，無機化學、有機化學、和分析化學為它提供了基礎知識。前二者為結構化學提供了研究的物件，後者則提供了研究的手段。全面地掌握這三者的知識內容為學好結構化學提供了堅實的基礎。

從探尋物質特性的手段上看，物理學為結構化學的研究方法提供了基礎。物質的一切物理特性，如力電磁熱光聲等都從不同的側面反映出物質結構的特性，成為結構化學研究的重要手段。

從建立和解析物質結構的模型上看，高等數學、數理統計、以及電子計算機應用是結構化學的基礎工具。

隨著科學技術的發展和人們對於物質性質的深入認識，邊緣學科、交叉學科的大量湧現，這幾個方面的界限正在被打破。新型的、近代的結構化學及其分支對基礎知識的要求提出了新的挑戰。這也是今後的結構化學學者們的用武之地。