你的這個問題實際上太大了，只能和你粗略地說一下。

首先要把該菌落進行分純培養，獲得純培養後才能有大量的細菌樣本以進行下一步的鑑定。

接著你就必須對這個細菌進行大體上的劃分，這一步是很重要的，分錯了之後怎麼鑑定都是錯的。先確定它是自養還是異養，形態是什麼（球菌、桿菌等），革蘭氏陰性還是陽性。像一些簡單的生化反應此時也可以提前做一做，比如氧化酶。

最後也就是最關鍵的，你判斷出了是哪一大類細菌，那麼就需要對這個細菌做詳細的生化反應，只有透過這個細菌不同的生化表現，才能最終判定它是什麼細菌，甚至需要血清凝集。

無疑，最後一步是最難的，因為可供選擇的生化反應非常之多，剛剛學會細菌鑑定的新手往往不知道該做哪些生化反應以儘快確定之。所以純靠手工鑑定那麼經驗就決定了鑑定速度和準確性。為了解決這一問題，現在人們透過建立細菌生化現象的資料庫，製作了各種適用於不同種類細菌的生化鑑定板條，這樣就方便多了。不過鑑定板條不是萬能的，有時候也離不開手工，而且在之前我也說了，一定要把細菌的大類判斷好，把細菌分類錯了，使用了錯誤的板條自然結果也是錯誤的。