工程竣工結算審計是控制工程造價的最後關口，直接影響著專案投資的真實性和合法性。因此，審計人員在工程結算審計時應把好“六關”：

一是把好合同審查關。工程結算審計應嚴格執行招投標檔案和合同的規定;合同條款與招投標檔案實質性內容相違背的，執行招投標檔案;兩份合同相矛盾的，執行後一份合同;合同價有下浮的，審定結算價應按相同比率下浮。

二是把好工程量計算關。審查有無多計、重複計算以及只計增項不減項的工程量，審查工程量計算規則是否正確。

三是把好定額套用稽核關。相同專案是否執行投標單價，投標書中沒有的專案是否高套或錯套定額。

四是把好材料價格稽核關。相同材料是否執行投標價，投標書中沒有的材料是否執行合同價或參照同期資訊價及市場詢價，價格波動大的主要材料還應按照合同和相關檔案規定的風險係數進行調整。

五是把好工程簽證稽核關。審查簽證手續是否齊全，有無建設、施工、監理部門簽字，設計變更籤證有無設計部門簽字蓋章及相關審批手續;在取費或定額含量中已包含的簽證是否重複計取;對有疑問的簽證要實地勘察、邏輯推理，必要時要開挖鑽孔。六是把好取費標準稽核關。審查各項取費計算的基數是否符合取費檔案和合同的規定，是否與投標書一致。