《雄兵連》是在《超神學院》系列動畫的基礎上重新制作了劇情。

《超神學院之雄兵連》並不能算是《超神學院》的第5季，因為《雄兵連》是重新構造了《超神學院》的故事架構。雖然在情節上沒有太大變動，但在很多細節上還是很有出入了，其最大的差別自然就是在畫質水平上面，明顯有很大的提升。

《雄兵連》原本是要拍成大電影的，後來由於種種原因，發展成了電影級畫質的長篇動畫。這也是雄兵連更完11集後斷更兩個月的原因吧，因為這11集的劇情基本上囊括了《超神學院》前3季和《黑甲》的內容，劇情發展也止步於此！應該屬於《超神學院》大電影第一部的劇情。

超神學院前幾季因為劇情大背景沒有完善，太多的細節經不起推敲，就拿小倫的能力來說，之前是說自然解鎖，現在是說蕾娜感知危險來臨，以太陽之光的能量啟用他們的基因，再透過努力逐步解鎖成為完全體，這樣很合理，琪琳的進場也豐富了，總之細節的改動自己慢慢體會。

《超神學院》前3季就不用說了，是最早出來的，後面出來的《黑甲》實則是《超神學院》第4季，是延續前三季的劇情，講述以薔薇為中心的抗戰故事。