原因：長門用外道·輪迴天生之術復活了在佩恩一戰所死之人，自來也是死在佩恩襲擊之前，長門的力量所剩無幾，無法復活。自來也死因：自來也為打探曉首領的情報，潛入了雨隱之村。之後見到了佩恩及小南，這才知道原來曉首領佩恩是自己第二次忍界大戰末期在雨隱之村所收的徒弟——長門。冷酷無情的佩恩已不再顧念師徒之情，師徒之戰一觸即發。自來也使出仙人模式，並召來兩位蛤蟆仙人（深作及志間仙人）相助，成功打敗了三個佩恩。但因之後不瞭解佩恩六道的能力，所以最終被佩恩六道打敗而犧牲。擴充套件資料第四次忍界大戰時期，長門被藥師兜用穢土轉生復活，並與宇智波鼬一起行動。後被兜控制與鳴人和奇拉比戰鬥。失去意識的長門，缺乏自主機動性。在吸收奇拉比的八尾查克拉後身體恢復了原來年輕狀態，但由於腿上的傷，依然無法自如行動，兜便以通靈獸的輪迴共享視野彌補這一缺點，相繼捕獲鳴人與奇拉比，兩人危在旦夕。但最終卻因中了別天神而脫離兜控制、隱蔽起來的宇智波鼬從死角射出苦無破壞視覺共享而失手。之後長門使出地爆天星，鼬分析出地爆天星的特徵以及弱點並引導鳴人與奇拉比一起合力使用最強遠端攻擊忍術破解了地爆天星，隨即長門被宇智波鼬的十拳劍所封印。