去除水葫蘆的方法有:

1、防治水體汙染：水體營養化是鳳眼藍不斷繁殖生長的根基，要從源頭上來防治鳳眼藍的泛濫。由於人們生活水平大幅度提高及人口不斷膨脹，生活汙水排放量及有機物含量大大提高。為鳳眼藍的生長提供了重要的營養源，所以要控制生活汙水的排放，以及工農業廢水的有序排放，確需排放時必須經無公害化水處理後再排放。

2、機械攪滅法：對鳳眼藍危害較大的水域，可以使用相關機械將其攪滅打碎，擴大水體的光照面積，增加水體的流動，確保養殖、捕撈及航運順利進行。擴充套件資料：水葫蘆的危害：1、阻斷航道，影響航運和排洩，成為農業、水利、環保的頭號敵人。2、限制了水體的流動，水體沒有Sunny照射，變得發臭，使水體中的溶氧量減少，抑制了浮游生物的生長，破壞了河涌生態環境。

3、為血吸蟲和腦炎流感等病菌提供了滋生地，滋生蚊蠅，為蚊子的幼蟲提供了呼吸和繁殖的機會。

4、破壞飲水資源。由於造成堵塞，水體不能自由流動，各種汙染源如重金屬元素及其對人體危害的其它微量元素不能有效清除，人直接或間接吸納到有汙染的水源。