食物不耐受也可以稱為慢性食物過敏，它是一種複雜的變態反應疾病，是人體免疫系統對進入體內的某些食物產生的過度保護性免疫反應，它可引起全身各系統的慢性症狀。食物不耐受主要是因為體內缺少某種消化酶而導致的。食物進入消化道後，由於人體缺乏相應的酶，或是食物中含有某些特殊的化學成分，或是由於胃腸道的屏障作用被破壞等，使得人體不能充分消化這種食物的大分子，免疫系統便將其當作有害物質來識別，從而導致過度保護的情況發生，引起一系列慢性症狀，就是食物不耐受。食物不耐受已被發現與人體諸多慢性疾病密切關係，如慢性鼻炎、鼻竇炎、哮喘、慢性咳嗽、慢性腹痛腹瀉、口臭、口腔潰瘍、噁心、胃腸脹氣、痤瘡、過敏性紫癜、蕁麻疹、關節炎、焦慮、憂鬱、偏頭痛、睡眠障礙、肥胖等，都可做食物不耐受檢測，這些症狀都可能與食物不耐受有關。

食物不耐受，指重複出現對特定食物或食物成分產生的不良反應；是由於免疫反應、酶缺乏、藥理作用、激惹反應以及毒理反應引起的；會引發許多慢性臨床症狀，主要表現在消化系統、面板症狀、神經系統等方面。食物不耐受不包括細菌、真菌、病毒、化學毒物、刺激性食物的毒性反應和主觀厭惡某種食物的心理反應。