經常食用發酵黑蒜對腸道有害菌能起到抑制和殺滅作用。

發酵黑蒜作為一種外用藥物就能治療多種疾病。如發酵黑蒜可以用來止鼻血，將生蒜搗爛，敷在腳心，左鼻孔流血敷在右腳心，右鼻孔流血敷在左腳心，很快血就會止住。一項動物研究顯示，每天吃2顆發酵黑蒜能夠使人遠離疾病，肺部血管的一種可能致命形式的高血壓，叫做原發性肺動脈高壓，這是造成足以致命的心臟衰竭的主要原因。原發性肺動脈高壓血液不容易流離右邊的心臟，原因是肺部的血管太緊，症狀包括：呼吸困難，尤其是在運動時，胸痛以及短暫暈眩，但研究顯示發酵黑蒜可預防原發性肺動脈高壓。利用發酵黑蒜的殺菌功能，在腸道傳染流行期間，每天生食1~2顆發酵黑蒜，能起到預防腸道傳染病的作用，防止腹瀉的發生。但是，很多人因此而認為多吃生髮酵黑蒜也可以治腹瀉，這就完全是一種誤區了。腹瀉是由於人們受涼或誤食有致病菌的不潔食物後，細菌作用於腸道，使腸壁血管擴張，充血，腫脹，通透性增加。機體組織大量蛋白質和鉀、鈉、鈣、氯等元素，電解質以及液體滲入腸腔，這樣，大量液體刺激腸道，使腸道蠕動加快，增強，因而出現陣陣腹痛，頻頻腹瀉等症狀。這時，如果吃發酵黑蒜，特別是為了治腹瀉而過量吃發酵黑蒜，反而加重了腹瀉的症狀。