三角龍是角龍科中最著名的一屬，角龍科是群大型北美洲角龍類恐龍。多年以來，三角龍於角龍下目中的位置處於爭論中。混淆來自於三角龍的短、堅硬頭盾類似尖角龍亞科，而長的額角類似角龍科（或稱開角龍亞科）。在第一個對於角龍類的研究中，理察·史旺·魯爾提出出兩個支系，一個往三角龍發展的支系包括獨角龍、尖角龍，另一個支系包括角龍、牛角龍，這個假設使三角龍屬於尖角龍亞科。較晚的研究支援這個觀點，並將這個短頭盾支系正式命名為尖角龍亞科（包含三角龍），另一長頭盾支系為開角龍亞科。

在1949年，查爾斯·斯騰伯格首次對這假設提出質疑，並基於頭顱與角的特徵，而認為三角龍與無鼻角龍、開角龍關係較近，使得三角龍屬為三角龍亞科（尖角龍亞科）。然而，斯騰伯格的分類與約翰·奧斯特倫姆、大衛·諾曼將三角龍置於尖角龍亞科不同。

後來的發現與研究支援了斯騰伯格的觀點，Lehman在1990年為兩個亞科定義，並基於數個形態上的特徵，而將三角龍歸於角龍亞科。事實上，除了短頭盾以外，三角龍相當符合角龍亞科的特徵。彼得·達德森在1990年的親緣分支分類法研究與1993年的形態學研究，加強三角龍歸類為角龍亞科的論點。