1. 麝香保心丸是屬於芳香溫通類藥物，而複方丹參滴丸屬於活血化瘀類藥物，重點是一個作用於“脈”一個作用於“血”，而作用於“血”的複方丹參滴丸不適合長期服用。而麝香保心丸保護血管內皮，長期使用對於冠心病患者有遠期獲益。、

2. 麝香保心丸具有快速緩解患者臨床症狀的特點，而複方丹參滴丸急救療效弱。

3. 麝香保心丸具有保護血管的作用，與阿司匹林取長補短，是理想的合用藥物。而複方丹參滴丸類似於抗血小板藥物，合用阿司匹林將增加重要臟器出血的危險。

4. 複方丹參滴丸冰片的含量是麝香保心丸的20倍，胃腸道刺激明顯。

5. 麝香保心丸的價效比要高於複方丹參滴丸且已被入選國家低價藥目錄品種。

6. 另外，麝香保心丸採用先進的微粒丸技術，受溼、熱、空氣的影響小；而滴丸天熱容易造成粘連，造成有效成分的析出，影響質量及療效。

7. 麝香保心丸是國家保密品種之一，而複方丹參滴丸並未在其列。