1.掛科最嚴重的影響就是可能造成大學生沒有學位證，畢業證，無法畢業。一般高校對學生都有規定的學分要求，學生只有修到相應數目才能拿到學位證並順利畢業。學分是以學生考試科目的成績進行計算的，即某一科透過考試，則獲得相應的學分；不透過（即掛科）則無學分，需要下次重修或補考。若掛科太多，重修不過，學生就會因學分不夠而被學校留級或勸退。進而會使學生有上面所說的無學位證或無法畢業的危險。這樣等於說大學白念，絕對得不償失。（關於掛多少科目就會無學位證的問題，不同的高校的規定是不同的。）

2.掛科會直接影響到大學生的成績排名，使其與獎學金、助學金、競選班幹部、入黨、保研、推薦工作、出國留學等等好事全部失之交臂。

3.掛科還會對大學生的心理造成巨大的傷害，例如會造成大學生有羞愧、恐懼、痛苦、自暴自棄等不良情緒。一般大學生得知他們掛科都是在期末考試後的暑、寒假裡，這樣掛科會對他們進行長時間的身心折磨。

4.掛科對於大學生的就業也將造成十分的嚴重影響。