1、出於少昊金天氏（以封邑為氏）

通志·氏族略載，少昊金天氏之子殷被封於尹城（今河南省宜陽縣西北、新安縣東南，一說在山西隰縣東北），任工正，被稱為尹殷。他的後裔世襲工正，居於尹城，即以封邑為姓。

2、出於伊姓（以官職為氏）

東漢應劭風俗通義載：商代初年的相國伊尹（名伊摯）的後人有一支以伊尹的官職尹為姓。故這一支尹姓出自伊姓。

尹姓發源於河南、山西、陝西一帶。西漢時尹姓已發展到河北、山東、陝西。兩漢之際遷入江浙一帶和貴州、廣西等地。魏晉南北朝時，秦州天水郡尹氏繁盛一時。隋唐時，尹姓已遍佈全國，冀州河間郡亦成為尹姓郡望。

明洪武、永樂年間，山西洪洞縣大槐樹的尹姓族人曾遷徙到華北各省因戰亂而人口銳減的地區。清代，有尹姓族人渡海入臺灣。

3、出自少數民族漢化

據《清朝通志·氏族略》記載，蒙古族博爾濟吉特氏、葉古祿特氏、音齋氏有的漢化尹姓；滿族錫伯族章佳氏有漢化為尹氏者；今白族、苗族、壯族、北韓族等均有尹姓分佈。