遊戲一共有三個特殊結局和一般結局，但是故事的發展並沒有分支，只有一條線。

　　一般結局沒有特殊要求，只要有EXP並且沒有滅絕所有怪物即可。最終BOSS是魔性小花

　　好結局要求不殺一隻怪（即到sans的裁決時LV和EXP為零），觸發三個約會事件，並完成真實驗室。最終boss是Asriel Dreemurr

　　壞結局要求滅絕所有怪物（即該地區內無法再踩到怪），一路殺到最後，如果你選擇這條線的話可以無視部分解密內容。最後的交易是永久的，除非換電腦或者重灌系統否則無法撤消。如果你是正版玩家的話這個交易還會和賬號繫結（STEAM雲存檔）。關於這個交易的存檔單獨儲存在另外的檔案裡，steam雲存檔可以手動關閉

　　真結局要求先觸發壞結局，接受交易，之後按照好結局的要求再玩一邊。這個路線基本上和好結局差不多，只不過在過程中和結局中稍微有一點不同（紅色字），另外多出了一些令人在意的細節。

　　在好結局的最後你可以選擇留下來或者離開，這個會影響最後出現的是全家福還是一小段羊媽送派動畫。