雖然有兩個執業醫師證但註冊原則上只能註冊一個（除非是在鄉鎮衛生院和社群衛生服務機構工作），這個衛生部早就有規定：

衛生部《關於醫師執業註冊中執業範圍的暫行規定》(衛醫發[2001]169號)

醫師進行執業註冊的類別必須以取得醫師資格的類別為依據。醫師依法取得兩個或兩個類別以上醫師資格的，除以下兩款情況之外，只能選擇一個類別及其中一個相應的專業作為執業範圍進行註冊，從事執業活動。醫師不得從事執業註冊範圍以外其他專業的執業活動。

在縣及縣級以下醫療機構（主要是鄉鎮衛生院和社群衛生服務機構）執業的臨床醫師，從事基層醫療衛生服務工作，確因工作需要，經縣級衛生行政部門考核批准，報設區的市級衛生行政部門備案，可申請同一類別至多三個專業作為執業範圍進行註冊。

在鄉鎮衛生院和社群衛生服務機構中執業的臨床醫師因工作需要，經過國家醫師資格考試取得公共衛生類醫師資格，可申請公共衛生類別專業作為執業範圍進行註冊；在鄉鎮衛生院和社群衛生服務機構中執業的公共衛生醫師因工作需要，經過國家醫師資格考試取得臨床類醫師資格，可申請臨床類別相關專業作為執業範圍進 行註冊。