先心病開胸手術是需要全身麻醉的。目前很多病人和家屬都很關心麻醉對病人的影響問題，尤其擔心全身麻醉可能會對病人智力、生長髮育等方面是否有負面影響。首先可以明確的是，目前所有的全身麻醉藥本身對病人的智力和生長髮育是沒有什麼不良影響的，除非長期使用或短期內多次反覆使用，而這種用藥情況在臨床上是基本不存在的。因此，患者和家屬完全可以不必為此而擔心，全身麻醉藥本身對病人智力和生長髮育等方面是很安全的。當然，如果手術過程中出現了嚴重的低血壓、缺氧、心臟驟停、血管內栓塞（空氣、脂肪等）而影響到大腦血供氧供，則可能造成大腦功能和/或機體其他器官功能的損害，這樣可能影響到病人的智力發育等。不過，這些意外的情況在手術麻醉過程中通常是很少發生的，並且醫護人員在這方面也非常用心和謹慎，有很多預防和救治措施都是時刻準備在手邊以便隨時使用，以期將各種意外事件的發生風險和危害減低到最小。

此外，全身麻醉用藥相對比較複雜，而這些藥物大多是透過肝臟代謝肝腎等途徑排洩的，其中有些藥物在大量或多次應用時可能會對肝腎等器官功能產生一定的損害作用，尤其術前已有肝腎功能異常的病人更需要注意。這方面麻醉醫師會根據病人的病情選擇合適的藥物以儘可能避免這方面的不良影響的。