整枝就是對結果枝條進行整理。由於西紅柿有無限生長、有限生長兩個型別，因而整枝方式也不同，生產上一般常用的方法有下面幾種。

1、單杆式 這是目前生產上普遍採用的整枝方法。單幹整枝每枝只留一個主幹。把所有側枝都陸續摘除打掉，主杆也在留足一定數目果穗數時摘心。這樣結果數目較少，而果型較大，在單位面積可以栽較多株數。

2、雙杆式 除主杆外再留第一花序直下葉腋所生的一條側枝（第一強側枝）為第二主杆作結果枝，而把其它側枝及雙幹上的再生枝全部摘除。這種方法株行距較大，每畝株數較少，以每畝3500株為宜。

3、一杆半整枝 留主杆的方法同單幹整枝，此外留第一穗果下方的一條側枝，讓這個側枝留一穗果後，果前留2片葉打頂，並去掉所有側枝，此種方法可以增加植株產量和果實產量，以每畝4000-5000株為宜。　　

4、單杆換頭整枝 留主杆的方法開始時同單杆整枝法，當主杆上第三花穗出現，其上留2片真葉打頂，待第一穗果座住後，在第二穗果下留一側枝代替主枝生長，其餘側枝全部去掉，以後這個新生枝出現第3花穗時，再留2片葉打頂，座果後在中部再培養一側枝當主枝，如此重複進行，直至栽培結束。