南瓜雖然對土壤條件要求不嚴格，但要獲得優質高產，在種南瓜時還需要施用一定的底肥，特別是在瘠薄的土壤上種植南瓜應施用較多的有機肥作底肥。一般每畝南瓜施用優質腐熟的農家肥4000～5000千克，撒勻後耙勻再作畦種瓜，如果肥源緊也可以先作畦後在畦中施肥，每畝施用2000～3000千克腐熟的農家肥作底肥。在南方每畝可增施10～15千克鈣鎂磷肥增加鈣鎂的含量。

（2）追肥要適宜。

南瓜追肥要根據它的不同生育階段，土壤肥力和植株長勢情況進行，在前期應少施氮肥，以防止徒長。在南瓜緩苗後，如果苗勢較弱，葉色淡而黃，可結合澆水追施1：3～4的淡糞水（即1份人糞尿加3～4份水），每畝用量250～300千克，追施發棵肥，在植株進入生長中期，坐住一兩個幼瓜時應在封壟前重施追肥，以保證有充足的養分。一般每畝追施1：2的糞水1000～1500千克，或是在根的周圍開一環形溝，施入優質腐熟的有機肥料，同時每畝配合施入硫酸銨10～15千克（或尿素7～10千克，或三元複合肥15～20千克）。在果實開始收穫後每畝追施三元複合肥10～15千克，防止植株早衰，保證後期產量。